創建は、建永元年（1206）で初めは白石の地にあり、宝珠山瑞雲寺といい、臨済宗のお寺でしたが、享徳3年（1454）に大内教弘が曹洞宗に、寺号も瑞雲山龍福寺と改めた。弘治3年（1557）4月に大内義長が毛利氏によって亡ぼされ、そのあとをついだ毛利隆元が大内氏館跡に大内義隆の菩提寺として建立した。明治14年焼失したため、現在の本堂は、明治16年氷上興隆寺の釈迦堂を移築したもの。