慶長８年（１６０３）蓮池主水、糟家弥兵衛が阿弥陀寺を建立し、両人の姓をとって蓮家寺と名付けられました。棚倉城主内藤氏による手厚い保護もあり、慶安元年（１６４８）には三代将軍家光より御朱印状を拝受しております。　国重要美術品の銅楼や町指定文化財の山門等数多くの文化財が遺されています。